蛋白質(zhì)是生命體最重要的分子之一,具有極其廣泛的功能和作用。傳統(tǒng)上,研究者可以利用細胞表達體系來制備需要的蛋白質(zhì),并對其進行深入的研究。然而,受限于細胞生長、維護、污染等因素,細胞表達體系面臨著一些瓶頸和挑戰(zhàn),特別是在高通量生產(chǎn)和定制蛋白質(zhì)方面更是如此。
為了突破這些限制以及為高效蛋白質(zhì)制備和研究提供更多選擇,無細胞蛋白表達技術(shù)應(yīng)運而生。它作為一種基礎(chǔ)研究工具已經(jīng)在生命科學(xué)中使用了五十多年,最近的技術(shù)發(fā)展促進了無細胞蛋白表達的高產(chǎn)。與傳統(tǒng)的細胞表達體系不同,無細胞表達體系可以在體外條件下完成蛋白質(zhì)的合成,并且具有高效、便捷、靈活以及高純度等優(yōu)點。隨著技術(shù)的發(fā)展無細胞蛋白表達技術(shù)正在成為生物醫(yī)藥和基礎(chǔ)研究領(lǐng)域中備受關(guān)注的新興技術(shù)之一。
圖1:無細胞蛋白表達系統(tǒng)的發(fā)展
今天,小編將從無細胞蛋白表達的概念、技術(shù)原理、關(guān)鍵技術(shù)細節(jié)等方面探討這一引人注目的技術(shù)。
無細胞蛋白表達是一種體外重組蛋白質(zhì)表達技術(shù)也稱為無細胞蛋白質(zhì)合成技術(shù)(CFPS:Cell-free protein synthesis),是指用含有蛋白合成必需的組分(核糖體,轉(zhuǎn)運RNA,氨酰合成酶,啟動/延伸/終止因子,三磷酸鳥苷,ATP,Mg2+和K+)的細胞裂解物在體外進行蛋白合成。
無細胞蛋白表達技術(shù)適用于制備各種類型的蛋白質(zhì),包括難表達蛋白質(zhì)、毒性蛋白質(zhì)、復(fù)雜蛋白質(zhì)等。在藥物研究、生物制造和生命科學(xué)等領(lǐng)域中得到廣泛關(guān)注和應(yīng)用,無論是研究、開發(fā)還是商業(yè)化應(yīng)用過程。目前無細胞蛋白表達主要應(yīng)用于藥物研發(fā)領(lǐng)域,例如抗體制備和生物藥物生產(chǎn)等。隨著人工智能技術(shù)的不斷發(fā)展,無細胞蛋白表達技術(shù)可以與人工智能算法結(jié)合,構(gòu)建計算機輔助的高通量生產(chǎn)系統(tǒng),實現(xiàn)個性化、精準的生物醫(yī)學(xué)治療。除此之外,還能夠應(yīng)用于其他領(lǐng)域,例如基因工程、環(huán)境保護和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)等。隨著無細胞蛋白表達技術(shù)的不斷發(fā)展和人工智能技術(shù)的不斷進步,我們可以看到更多的新領(lǐng)域和新應(yīng)用出現(xiàn),給生物科技行業(yè)帶來更多的機遇和挑戰(zhàn)。
CFPS系統(tǒng)使用微生物、植物或動物的粗細胞裂解物中的成分來合成蛋白質(zhì)。常用的粗提取物是大腸桿菌、兔網(wǎng)織紅細胞、小麥胚芽(WGE)、昆蟲細胞或市售的純化重組元件系統(tǒng)(PURE)。CFPS系統(tǒng)的制備是一個簡單的過程,其中目的細胞過夜生長,稀釋,并進一步生長,直到光密度達到0.8至1.0,之后收獲細胞并超聲處理以提取細胞裂解物。然后將添加了必要輔因子、能量源、核苷酸、底物、氨基酸和tRNA的緩沖混合物添加到細胞提取物中,將其轉(zhuǎn)化為CFPS和無細胞轉(zhuǎn)錄-翻譯(TX–TL)系統(tǒng)。
CFPS系統(tǒng)的一般方案如圖3所示,該實驗使用含有必要細胞裂解物和DNA(線性或質(zhì)粒)的緩沖液,以及相關(guān)的能量源、核苷酸、氨基酸、鹽和輔因子,共同維持反應(yīng)以合成感興趣的產(chǎn)物。CFPS的合成產(chǎn)物可能因多種化學(xué)或生物部分而異,包括病毒、治療劑、抗體、化學(xué)品、生物燃料和蛋白質(zhì)。在合成此類產(chǎn)物時,CFPS系統(tǒng)相對于體內(nèi)系統(tǒng)具有直接優(yōu)勢,特別是考慮到該技術(shù)的相對速度、簡單性和有效性。通常,體內(nèi)系統(tǒng)是耗時的,并且往往比CFPS系統(tǒng)有更多的步驟。
1
反應(yīng)體系
2
反應(yīng)條件
需要根據(jù)實驗要求調(diào)整反應(yīng)條件,包括溫度、離子強度、pH、反應(yīng)時間等多個方面,有利于促進核苷酸的轉(zhuǎn)錄和翻譯,以及蛋白質(zhì)的自組裝和成型。
3
生產(chǎn)規(guī)模
無細胞蛋白表達技術(shù)可以擴大生產(chǎn)規(guī)模,提高生產(chǎn)效率,但需要保證反應(yīng)體系的穩(wěn)定性和可重復(fù)性,同時要保證反應(yīng)環(huán)境的清潔和消毒,以避免其他污染物的進入,從而影響蛋白質(zhì)的純度和活性。
1
更高的蛋白質(zhì)表達量
2
更快的表達速度
傳統(tǒng)活細胞蛋白表達需要細胞生長并達到最佳密度時才能進行蛋白質(zhì)表達,這個過程往往需要數(shù)天時間。而無細胞蛋白表達技術(shù)通常只需要數(shù)小時就能夠完成蛋白質(zhì)的表達,這個速度明顯快于傳統(tǒng)活細胞表達技術(shù)。
3
更精準的蛋白質(zhì)合成
無細胞蛋白表達技術(shù)在體外進行蛋白質(zhì)合成,能夠精確控制底物濃度、反應(yīng)溫度、反應(yīng)劑比例等參數(shù),因此可以更加精準地合成定制的蛋白質(zhì),這對于研究和應(yīng)用來講具有重要意義。
4
更靈活控制
在無細胞蛋白表達技術(shù)中,可以使用分離的組分體系進行蛋白質(zhì)的合成,可以控制底物和反應(yīng)劑的比例,也可以在適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)條件下進行自定義的修飾,如蛋白質(zhì)標記、藥效分析等。這些優(yōu)點使得無細胞蛋白表達技術(shù)更加靈活、可控,適用于更廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域。
圖4:體內(nèi)細胞和體外無細胞蛋白質(zhì)合成比較
1
醫(yī)療領(lǐng)域
2
制藥領(lǐng)域
3
基礎(chǔ)研究領(lǐng)域
利用無細胞蛋白質(zhì)合成系統(tǒng)可以直接對表達產(chǎn)物進行核磁共振分析,目前已確定了數(shù)千個蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)??梢酝ㄟ^合成蛋白質(zhì)建立蛋白質(zhì)陣列,解開基因產(chǎn)物的功能;應(yīng)用核糖體展示和 mRNA 展示技術(shù),更有利于實現(xiàn)高通量篩選,全面深入研究基因特征和功能。通過無細胞蛋白表達技術(shù)可以實現(xiàn)對大型蛋白質(zhì)的生產(chǎn)和分析,同時也為基礎(chǔ)研究打開了新的研究領(lǐng)域。
另一方面,無細胞蛋白表達技術(shù)和人工智能技術(shù)的結(jié)合也可以拓展生物醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用范圍。例如,利用無細胞蛋白表達技術(shù)和人工智能技術(shù)可以快速高效地生產(chǎn)一些生物標志物或特定蛋白質(zhì),用于生物檢測和診斷。同時,人工智能技術(shù)可以根據(jù)病態(tài)組織特異性標識,利用無細胞蛋白表達技術(shù)高效合成具有特定作用的生物藥劑,實現(xiàn)精準醫(yī)療和個性化治療,具有廣闊的研究和應(yīng)用前景。
參考文獻:
微信掃一掃